Agenția are următoarele atribuții principale:
a) elaborează, implementează și promovează strategia națională pentru produsele de calitate;
b) elaborează și implementează programe de marketing pentru produsele de calitate;
c) recunoaște și certifică/atestă produsele de calitate;
d) elaborează programe pentru promovarea pe piața internă și pe piețele terțe a produselor certificate conform unui sistem de calitate instituit la nivel european sau național; aplică pentru finanțare în cadrul programelor de finanțare europene; acordă consultanță operatorilor eligibili din România să elaboreze proiecte pentru obținerea de finanțări pentru marketingul produselor de calitate;
e) inițiază sau elaborează ori, după caz, avizează proiecte de acte normative care reglementează sistemele voluntare de certificare a calității produselor agroalimentare;
f) asigură consultanță către operatorii economici;
g) asigură și implementează un sistem electronic pentru monitorizarea trasabilității produselor de calitate certificată;
h) elaborează orientări, analize, strategii și studii de conjunctură și de marketing în vederea stabilirii evoluției și a tendințelor pieței produselor de calitate, a modificărilor structurale în opțiunile sociale ale populației, pentru orientarea structurii, înnoirii și diversificării ofertei de produse alimentare de calitate atât pe piața internă, cât și la export;
i) asigură verificarea conformității sistemelor de calitate voluntară propuse pentru produsele de calitate în conformitate cu prevederile legislației naționale și europene;
j) identifică și implementează surse de finanțare specifice pentru certificarea exploatațiilor agricole ale micilor producători/procesatori;
k) asigură, în domeniile sale de activitate, înregistrarea operatorilor economici în sectorul agroalimentar de pe filiera de produs, în strânsă colaborare cu organizația interprofesională corespondentă;
l) cooperează cu organizațiile care elaborează statistici oficiale pentru efectuarea cercetărilor statistice prevăzute în Programul statistic național anual;
m) elaborează ghiduri de bună practică pentru sistemele de calitate;
n) autorizează importul produselor ecologice din terțe țări în Uniunea Europeană;
o) aprobă cererile solicitanților pentru utilizarea siglei «ae» - Agricultura Ecologică;
p) asigură legătura cu autoritățile interne și internaționale din domeniu, pentru produsele de calitate certificată;
q) implementează sistemele de calitate instituite prin legislație națională și poate certifica produsele conform acestor sisteme, după caz;
r) verifică și recunoaște sistemele de certificare voluntară private conform reglementărilor europene;
s) implementează sistemele de calitate instituite de regulamentele europene și notifică Comisiei Europene sistemele de calitate naționale înaintea transpunerii lor în legislația națională;
ș) asigură transmiterea informațiilor provenite de la Comisia Europeană către instituțiile și operatorii economici din domeniul de activitate;
t) elaborează și implementează programe educative și de cercetare privind produsele de calitate;
ț) îndeplinește orice alte sarcini care derivă din exercitarea funcțiilor delegate de către Ministerul Agriculturii și Dezvoltării Rurale.