Pentru îndeplinirea scopurilor prevăzute la art. 3, Institutul are următoarele atribuții principale:
a) asigură îndrumarea tehnică și metodologică a rețelei de sănătate publică prin structurile sale naționale și regionale;
b) participă la elaborarea strategiilor și politicilor din domeniul sănătății publice;
c) elaborează proiecte de acte normative, norme, metodologii și instrucțiuni privind domeniile specifice din cadrul sănătății publice;
d) efectuează expertize, oferă asistență tehnică și realizează servicii de sănătate publică, la solicitarea unor persoane fizice sau juridice;
e) supraveghează starea de sănătate a populației, bolile transmisibile și netransmisibile, pentru identificarea problemelor de sănătate comunitară;
f) asigură sistemul de supraveghere epidemiologică, precum și de alertă precoce și răspuns rapid și participă la schimbul de informații în cadrul rețelei europene de supraveghere epidemiologică în domeniul bolilor transmisibile;
g) participă la efectuarea de investigații epidemiologice de teren, din proprie inițiativă, la solicitarea Ministerului Sănătății sau a direcțiilor de sănătate publică;
h) elaborează metodologia, instrumentele și indicatorii de monitorizare și evaluare a serviciilor și programelor de sănătate publică, de promovare a sănătății și de educație pentru sănătate;
i) participă la procesul de învățământ medical de specializare și perfecționare în domeniile specifice din cadrul sănătății publice, atât ca unitate acreditată să desfășoare programe de specializare prin rezidențiat, cât și prin alte forme de învățământ de specialitate medical, medico-sanitar și farmaceutic uman;
j) desfășoară activități de cercetare-dezvoltare în domeniul sănătății publice și al managementului sanitar;
k) asigură sistemul informațional integrat pentru managementul sănătății publice;
l) colectează, analizează și diseminează datele privind starea de sănătate a populației și alte aspecte de sănătate publică;
m) efectuează analize, studii și anchete medicale privind starea de sănătate a populației;
n) comunică și transmite datele statistice din domeniul sănătății către organizațiile internaționale din care România face parte, Organizația Mondială a Sănătății, EUROSTAT, Organizația pentru Cooperare și Dezvoltare Economică, sau cele față de care are angajamente conform legii, la cererea acestora;
o) realizează activități de informare și documentare medicală, în special în domeniul programelor inițiate și derulate de Comisia Europeană și Organizația Mondială a Sănătății.