Comisia de specialitate are următoarele atribuții:
1. coordonează, din punct de vedere științific și metodologic, rețeaua de asistență medicală corespunzător domeniului de specialitate din sfera sa de competență;
2. identifică și propune ministrului sănătății prioritățile naționale pe termen scurt, mediu și lung, corespunzător domeniului de specialitate din sfera sa de competență;
3. participă la elaborarea Strategiei naționale de sănătate;
4. elaborează ghidurile și protocoalele de practică medicală, pe care le supune aprobării ministrului sănătății;
5. elaborează propuneri pentru pachetele de servicii medicale care se asigură în cadrul sistemului de sănătate;
6. participă la procesul de evaluare a tehnologiilor medicale, în conformitate cu metodologia aprobată prin ordin al ministrului sănătății;
7. colaborează cu organisme profesionale din sistemul de sănătate și instituții academice în cadrul procesului de evaluare a tehnologiilor medicale;
8. fundamentează deciziile ministrului sănătății cu privire la politicile, strategiile și programele de acțiune în domeniul sănătății populației din sfera sa de competență, în acord cu Programul de guvernare;
9. elaborează criteriile specifice necesare în vederea constituirii registrelor naționale pentru bolile cu impact major asupra sănătății;
10. colaborează cu structurile de specialitate din cadrul Ministerului Sănătății pentru elaborarea programelor de pregătire profesională, organizarea și desfășurarea activității de învățământ;
11. coordonează activitatea subcomisiilor pe care le are în structura sa;
12. participă la acțiunile de control și evaluare a activității de specialitate din instituțiile sanitare, la solicitarea Ministerului Sănătății;
13. colaborează cu Comisia națională de acreditare a spitalelor la elaborarea și fundamentarea criteriilor și standardelor de acreditare în vederea acreditării spitalelor;
14. elaborează și propune ministrului sănătății dotarea minimă obligatorie cu aparatură medicală și materiale sanitare a unităților sanitare, pe tipuri de spitale;
15. elaborează și propune ministrului sănătății nomenclatoare cu tehnologii specifice sistemului de sănătate;
16. participă, prin specialiștii desemnați, la elaborarea documentației pentru produsele care fac obiectul procedurilor de achiziții publice organizate de Ministerul Sănătății;
17. propune ministrului sănătății medicamentele, materialele sanitare și echipamentele medicale care pot fi incluse în Lista cu medicamentele, materialele sanitare, echipamentele medicale, echipamentele de protecție, serviciile, combustibilii și lubrifianții pentru parcul auto pentru care se organizează achiziții publice centralizate, la nivel național, în condițiile legii;
18. colaborează cu societățile științifice sau asociațiile profesional-științifice în problemele majore ori de interes național din sfera sa de competență;
19. formulează și propune ministrului sănătății criteriile de evaluare a unităților sanitare sau secțiilor/compartimentelor de specialitate din sfera sa de competență;
20. participă la procesul de guvernanță clinică, de îmbunătățire continuă a calității actului medical și a siguranței pacientului prin elaborarea de proceduri și standarde specifice, precum și prin monitorizarea modului de implementare a acestora;
21. evaluează, la solicitarea Ministerului Sănătății, recomandările formulate de către comisiile de specialitate teritoriale pentru trimiterea la tratament medical în străinătate a unor categorii de bolnavi;
22. propune ministrului sănătății președintele fiecărei comisii de specialitate teritoriale constituite în vederea trimiterii la tratament medical în străinătate a unor categorii de bolnavi;
23. îndeplinește și alte sarcini stabilite de ministrul sănătății, în acord cu specificul domeniului de activitate pe care îl coordonează;
24. fundamentează deciziile ministrului sănătății cu privire la problemele specifice domeniului de specialitate din sfera sa de competență, vizând:
a) elaborarea politicilor și strategiilor Ministerului Sănătății în domeniul său de competență;
b) elaborarea de criterii și standarde de performanță pentru organizarea, monitorizarea și evaluarea activității medicale din unitățile sanitare;
c) achiziția de aparatură de înaltă performanță pentru dotarea unităților sanitare publice;
d) pregătirea continuă a personalului medical de specialitate din sistemul de sănătate;
e) pregătirea prin rezidențiat a medicilor specialiști (numărul de posturi necesar pentru pregătirea prin rezidențiat, criteriile de admitere, structura pregătirii, precum și alte atribuții);
f) elaborarea criteriilor de admitere pentru obținerea celei dea doua specialități;
g) programul de investiții pentru dezvoltarea și modernizarea sistemului de sănătate;
h) organizarea și funcționarea structurilor de specialitate din sistemul de sănătate.
În domeniul programelor naționale de sănătate, comisia de specialitate colaborează cu direcțiile de specialitate din cadrul Ministerului Sănătății pentru:
a) identificarea și rezolvarea cu prioritate a problemelor de sănătate specifice domeniului său de competență, în conformitate cu Strategia națională de sănătate a Ministerului Sănătății;
b) evaluarea nevoilor populației, evidențiate din date obiective;
c) asigurarea concordanței programelor naționale de sănătate cu politicile, strategiile și recomandările instituțiilor și organizațiilor internaționale în domeniu;
d) definirea structurii, obiectivelor, activităților, precum și a oricăror altor condiții și termene necesare implementării și derulării programelor naționale de sănătate;
e) elaborarea criteriilor de selecție a unităților de specialitate prin care se implementează programele naționale de sănătate;
f) estimarea și fundamentarea necesarului de resurse financiare în raport cu obiectivele și activitățile cuprinse în programele naționale de sănătate, precum și cu politicile, strategiile și recomandările instituțiilor și organizațiilor internaționale în domeniu;
g) stabilirea măsurilor necesare în vederea îmbunătățirii modului de derulare a programelor naționale de sănătate;
h) propunerea unităților de asistență tehnică și management al programelor naționale de sănătate;
i) elaborarea de criterii, standarde și metodologii pentru evaluarea impactului, oportunității și eficienței programelor naționale de sănătate;
j) controlul și analiza modului de aplicare de către personalul medical cu responsabilități în implementarea programelor naționale de sănătate a ghidurilor de practică medicală, protocoalelor de diagnostic și a protocoalelor terapeutice privind prescrierea medicamentelor care se acordă în cadrul programelor naționale de sănătate, aprobate în condițiile legii.