Administrația Fondului pentru Mediu îndeplinește următoarele activități:
a) organizează primirea cererilor de finanțare formulate de potențialii beneficiari și a proiectelor propuse;
b) organizează selecția proiectelor depuse de către solicitanți;
c) notifică Consiliului Concurenței proiectele care urmează a fi finanțate din Fondul pentru mediu, după caz;
d) stabilește obligațiile contractuale dintre Administrația Fondului pentru Mediu și potențialii beneficiari;
e) urmărește și controlează implementarea proiectelor aprobate și finanțate;
f) verifică, autorizează și efectuează plățile către beneficiarii de finanțare din Fondul pentru mediu;
g) efectuează controale la beneficiarii proiectelor finanțate pentru a stabili dacă sunt respectate condițiile acordării finanțării și ori de câte ori se consideră necesar;
h) exercită controlul privind îndeplinirea obligațiilor ce revin operatorilor economici beneficiari ai finanțărilor către Fondul pentru mediu privind implementarea proiectelor finanțate;
i) urmărește colectarea veniturilor Fondului pentru mediu, reprezentând taxe și contribuții datorate de către plătitori, persoane juridice și persoane fizice, conform prevederilor art. 9 alin. (1) din Ordonanța de urgență a Guvernului nr. 196/2005, aprobată cu modificări și completări prin Legea nr. 105/2006, cu modificările și completările ulterioare;
j) asigură evidența contribuabililor;
k) efectuează monitorizarea depunerii de către operatorii economici a declarațiilor privind obligațiile la Fondul pentru mediu;
l) desfășoară activități de inspecție fiscală pentru taxele și contribuțiile datorate la bugetul Fondului pentru mediu;
m) inițiază și desfășoară acțiuni legale în cazul neconformării contribuabililor în îndeplinirea obligațiilor declarative și de plată;
n) ia măsuri privind executarea silită a datornicilor la Fondul pentru mediu;
o) exercită supravegherea și urmărirea în legătură cu aplicarea și respectarea Ordonanței de urgență a Guvernului nr. 196/2005, aprobată cu modificări și completări prin Legea nr. 105/2006, cu modificările și completările ulterioare;
p) soluționează contestațiile care au ca obiect obligațiile de plată ale persoanelor juridice și fizice la Fondul pentru mediu, conform prevederilor legale;
q) analizează periodic modul de realizare a veniturilor Fondului pentru mediu, stabilind măsurile necesare pentru încadrarea acestora în nivelurile stabilite prin bugetul de venituri și cheltuieli;
r) exercită controlul financiar preventiv propriu;
s) aplică legislația în domeniul resurselor umane - salarizare, recrutare/angajare numire, sancționare, suspendare, modificare și încetare a raporturilor de serviciu sau, după caz, a raporturilor de muncă, în condițiile legii;
ș) elaborează și derulează programe de perfecționare profesională a personalului propriu;
t) asigură, potrivit legii, tipărirea formularelor și imprimatelor tipizate utilizate în domeniul său de activitate;
ț) exercită funcția de audit public intern, în condițiile prevăzute de lege;
u) gestionează sisteme informatice care permit desfășurarea activității instituției în condițiile legii;
v) îndeplinește atribuții specifice domeniului gestionării asistenței financiare rambursabile sau nerambursabile europene sau din alte fonduri externe, conform legislației specifice.