În realizarea funcțiilor sale, Agenția Națională pentru Protecția Mediului are următoarele atribuții principale:
1. atribuții pentru realizarea funcției de suport tehnic pentru fundamentarea proiectelor actelor cu caracter normativ, a strategiilor și a politicilor sectoriale, precum și a planurilor de acțiune în domeniul protecției mediului;
a) asigură suportul tehnic privind consolidarea sistemului statistic de mediu, propune și participă la elaborarea sistemului indicatorilor statistici ai dezvoltării durabile, sub coordonarea autorității centrale pentru protecția mediului;
b) asigură suport tehnic pentru elaborarea documentelor din domeniul protecției mediului care derivă din obligațiile României ca stat membru al Uniunii Europene sau ca parte la convenții internaționale;
c) asigură suport tehnic privind stabilirea condițiilor, metodelor și mijloacelor utilizate pentru monitorizarea calității factorilor de mediu;
2. atribuții pentru realizarea funcției de implementare a politicilor, strategiilor și legislației din domeniul protecției mediului, la nivel național:
a) urmărește stadiul și asigură implementarea legislației naționale în domeniul protecției mediului și întocmește periodic și la solicitarea autorității publice centrale pentru protecția mediului rapoarte privind stadiul realizării acesteia;
b) monitorizează stadiul îndeplinirii angajamentelor în domeniul protecției mediului, asumate prin Tratatul dintre Regatul Belgiei, Republica Cehă, Regatul Danemarcei, Republica Federală Germania, Republica Estonia, Republica Elenă, Regatul Spaniei, Republica Franceză, Irlanda, Republica Italiană, Republica Cipru, Republica Letonia, Republica Lituania, Marele Ducat al Luxemburgului, Republica Ungară, Republica Malta, Regatul Țărilor de Jos, Republica Austria, Republica Polonă, Republica Portugheză, Republica Slovenia, Republica Slovacă, Republica Finlanda, Regatul Suediei, Regatul Unit al Marii Britanii și Irlandei de Nord (state membre ale Uniunii Europene) și Republica Bulgaria și România privind aderarea Republicii Bulgaria și a României la Uniunea Europeană, semnat de România la Luxemburg la 25 aprilie 2005, ratificat prin Legea nr. 157/2005, și întocmește periodic, la solicitarea autorității publice centrale pentru protecția mediului, rapoarte de evaluare pentru informarea acesteia;
c) urmărește îndeplinirea cerințelor legislației de mediu din actele de reglementare, constată neconformitățile și ia măsurile care se impun în conformitate cu competențele stabilite de legislația în vigoare;
d) elaborează rapoartele în formatele stabilite de Comisia Europeană, Agenția Europeană de Mediu, Agenția Europeană pentru Chimicale, EUROSTAT și de către secretariatele convențiilor și protocoalelor în domeniul protecției mediului la care România este parte, cu excepția rapoartelor prevăzute de legislația din domeniul zgomotului ambiant, și le supune spre avizare autorității publice centrale pentru protecția mediului în vederea raportării acestora;
e) organizează, actualizează și gestionează sistemul informațional și baza de date referitoare la informația de mediu, inclusiv a Biroului de asistență tehnică în domeniul chimicale;
f) asigură funcționarea laboratoarelor naționale de referință pentru aer, deșeuri, zgomot și vibrații, radioactivitate;
g) elaborează anual Raportul național privind starea mediului;
h) elaborează, actualizează și monitorizează implementarea Planului național de acțiune pentru protecția mediului;
i) poate delega, conform prevederilor legale, în totalitate sau în parte, instituțiilor din subordine, parcurgerea procedurii de evaluare a impactului asupra mediului, precum și a celei de evaluare adecvată; emiterea actelor de reglementare nu poate face obiectul delegării de competență;
j) asigură realizarea anuală a Inventarului Național al emisiilor de gaze cu efect de seră, denumit în continuare INEGES, în conformitate cu prevederile legislației naționale în vigoare în domeniul Sistemului național pentru estimarea nivelului emisiilor antropice de gaze cu efect de seră rezultate din surse sau din reținerea prin sechestrare a dioxidului de carbon, reglementate prin Protocolul de la Kyoto (SNEEGHG), pe care îl supune aprobării autorității publice centrale pentru protecția mediului în vederea transmiterii acestuia la Secretariatul Convenției-cadru a Națiunilor Unite privind schimbările climatice (UNFCCC), la Comisia Europeană, precum și la Agenția Europeană de Mediu;
k) administrează Registrul național al emisiilor de gaze cu efect de seră, conform prevederilor legale naționale, ale Uniunii Europene și internaționale în vigoare;
l) asigură implementarea schemei de comercializare a certificatelor de emisii de gaze cu efect de seră, sub coordonarea autorității publice centrale pentru protecția mediului;
m) elaborează Inventarul național de emisii de poluanți în atmosferă;
n) monitorizează stadiul implementării Agendei locale 21 la nivel regional și local;
o) asigură funcționarea Comisiei tehnico-economice care aprobă/avizează, după caz, indicatorii tehnico-economici pentru obiectivele de investiții ale aparatului propriu și ale agențiilor din subordine și care urmează a fi transmiși autorității publice centrale pentru protecția mediului în vederea analizei și avizării în Comisia tehnico-economică proprie;
p) monitorizează activitatea custozilor ariilor protejate;
3. atribuții pentru realizarea funcției de coordonare a activității agențiilor regionale pentru protecția mediului și a agențiilor județene pentru protecția mediului:
a) coordonează activitatea laboratoarelor agențiilor județene pentru protecția mediului;
b) coordonează desfășurarea procesului de planificare de mediu la nivel regional și local și realizarea planurilor de acțiune pentru mediu;
c) organizează și coordonează secretariatele tehnice, la nivel național, și secretariatele comisiilor, constituite la propunerea autorității publice centrale pentru protecția mediului, și asigură accesul publicului la informația de mediu, precum și participarea acestuia la luarea deciziilor privind mediul;
d) coordonează administrarea ariilor naturale protejate care nu sunt atribuite în custodie;
e) coordonează sistemul național de monitorizare a factorilor de mediu;
4. atribuții pentru realizarea funcției de autoritate care emite acte de reglementare, potrivit prevederilor legale:
a) reglementează activitățile cu impact asupra mediului, inclusiv cele din domeniul prevenirii și controlului integrat al poluării, potrivit competențelor stabilite în actele normative în vigoare, și coordonează aplicarea unitară a acestora, la nivel național;
b) constată neconformitățile din actele de reglementare emise de instituțiile din subordine, în urma controlului propriu sau la sesizare, și dispune măsurile legale ce se impun;
5. atribuții pentru realizarea funcției de instruire și perfecționare a personalului aparținând instituțiilor publice din subordine:
a) asigură instruirea personalului aparținând instituțiilor publice din subordine cu privire la implementarea legislației din domeniul protecției mediului și a măsurilor din planurile și programele de acțiune pentru protecția mediului;
b) asigură instruirea personalului aparținând instituțiilor publice din subordine cu privire la elaborarea de proiecte pentru protecția mediului la nivel local, precum și pentru elaborarea oricăror rapoarte sau documente solicitate;
6. atribuții pentru realizarea funcției de reprezentare în domeniul său de activitate, în relațiile interne și externe, conform mandatului acordat de către conducătorul autorității publice centrale pentru protecția mediului:
a) colaborează, în exercitarea atribuțiilor sale, cu celelalte autorități ale administrației publice centrale și locale, instituții publice, precum și cu alte organisme interesate, în baza mandatului acordat de autoritatea publică centrală pentru protecția mediului;
b) colaborează cu agenții naționale sau federale similare și desfășoară acțiuni de cooperare internațională, în limitele mandatului acordat de autoritatea publică centrală pentru protecția mediului;
c) participă la programe și proiecte internaționale și la parteneriate în proiecte de interes public, cu avizul autorității publice centrale pentru protecția mediului;
d) asigură legătura cu Agenția Europeană de Mediu prin centrele naționale de referință desemnate la nivelul Agenției Naționale pentru Protecția Mediului;
7. îndeplinește și alte atribuții stabilite de autoritatea publică centrală pentru protecția mediului.